Ve hře se ocitnete v roli nově infikovaného protagonistu, zkušeného seržanta Jamese Hellera vybaveného jedinečnými novými zbraněmi. Postupně si vybudujete rozsáhlý genetický arzenál smrtících biologických zbraní a schopností, které Vám pomohou při lovu a zabíjení na cestě ke konečnému cíli - zabít. Alexe Mercera. ! Síla tendrily - připravte se předvést ultimátní ničení díky změnám své podoby. Seržant James Heller zvedá auta a vojenskou techniku, chytá silné infikovaná zvířata a trhá velké skupiny nepřátel na kusy. Připravte se rozpoutat peklo! Přizpůsobte si svého zabijáka - Prototype 2 Vám přináší hrubou sílu postavy, kterou si můžete přizpůsobit podle preferencí, což Vám umožňuje kreativní kombinovat nové mutace do konečného prototypu. Rychlejší pohyb, větší síla, ostřejší drápy, nebo dokonce lepší krytí - volba je na Vás! Lovte - Zabíjejte - Staňte se monstrem - představte si, že můžete sledovat jakéhokoli nepřítele pomocí výkonného sonaru - pulsu z Vašeho těla! Také se můžete změnit za kohokoliv, kdo Vám stojí v cestě - například vojáka, vědce, zatímco pohltí jejich vzpomínky a získáte nové schopnosti. Na velikosti záleží - využitím jedinečného nového enginu"Titanium 2. 0", Vám Prototype 2 nabídne rozsáhlý otevřený svět plný akce - přejděte křížem přes město po ulicích nebo vysoko nad hlavami vojáků Blackwatch!.